Mechanizmy odpornościowe Candida albicans w stosunku do naturalnych substancji antymikrobiologicznych / Resistance mechanisms of Candida albicans against natural antimicrobial agents

 

Opis w języku polskim

Description in English

Dyscyplina / Discipline

nauki biologiczne

biological sciences

Promotor / Supervisor

Dr hab. Grzegorz Chrzanowski, prof. UR

gchrzanowski@ur.edu.pl

Dr hab. Renata Zadrąg-Tęcza, prof. UR

promotor pomocniczy

retecza@ur.edu.pl

Dr hab. Grzegorz Chrzanowski, prof. UR gchrzanowski@ur.edu.pl

Dr hab. Renata Zadrąg-Tęcza, prof. UR

assistant supervisor

retecza@ur.edu.pl

Tytuł tematu badawczego / Title of the research topic

Mechanizmy odpornościowe Candida albicans w stosunku do naturalnych substancji antymikrobiologicznych

Resistance mechanisms of Candida albicans against natural antimicrobial agents

Opis tematu badawczego / Description of the research topic

Skuteczne zwalczanie patogenów wymaga poszukiwania substancji o wysokim powinowactwie i wysokiej toksyczności do bakterii i grzybów, jednocześnie nie wykazując szkodliwości w stosunku do zwierząt i owadów pożytecznych.

Z drugiej strony mikroorganizmy mogą rozwinąć odziedziczoną lub nabytą zdolność oporności na działanie substancji przeciwbakteryjnych.

W związku z tym konieczne jest zrozumienie oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe i należy zająć się kwestią jej rozprzestrzeniania. Typowanie organizmu na podstawie całkowitej ekspresji białka jest przydatne do zrozumienia rozwoju lekooporności. Ponadto analiza białek wykrywa ekspresję genetyczną i pokazuje charakterystykę gatunku na podstawie zmian morfologicznych.

Dlatego sugeruje się, że profil białkowy jest kluczowym markerem zmiany oporności na leki przeciwgrzybicze.

Badania prowadzone przez doktoranta (metodami HPLC/UHPLC i spektrometrii mas) będą dotyczyły analizy metabolitów wytwarzanych przez mikroorganizmy. Ponadto student przeprowadzi elektroforezę SDS-PAGE i/lub 2D oraz identyfikację białek (za pomocą LC-MS/MS) w celu sporządzenia profilu proteomicznego pod działaniem naturalnych środków przeciwdrobnoustrojowych.

Effective pathogen control requires the search for substances with high affinity and lethal potency against microorganisms, without any toxicity to the animals and beneficial insects. Thus, it is necessary to target the pathogens as selectively as possible.

On the other hand, microorganisms can develop inherited or acquired ability to resist the action of antimicrobial agents.

Thus, it is necessary to understand antimicrobial resistance and its spread. Typing of the organism based on the total protein expression is useful for understanding the development of drug resistance. Moreover, analysis of the proteins detects the genetic expression and shows species characterization based on the morphological changes.

Therefore, the protein profile is suggested as the key marker of a shift in antifungal resistance.

Research conducted by the Ph.D. student (using HPLC/UHPLC and mass spectrometry methods) will involve the analysis of metabolites produced by microorganisms. Moreover, the student will conduct SDS-PAGE and/or 2D-electrophoresis and identification of proteins (LC-MS/MS) to draw a proteomic profile under natural antimicrobial agent treatment.

Słowa klucze / Keywords

metabolomika, SDS-PAGE, 2D- elektroforeza, identyfikacja białek, chromatografia cieczowa sprzężona ze spektrometrią mas

metabolomics, SDS-PAGE, 2D-electrophoresis, protein identification, liquid chromatography coupled mass spectrometry

Oczekiwane kompetencje/umiejętności od kandydata na doktoranta / Expected competences/skills from the candidate for a PhD student

  • tytuł magistra Biologii lub Biotechnologii;
  • mile widziane doświadczenie w analizie białek;
  • mile widziane doświadczenie w biochemii i biologii molekularnej
  • znajomość języka angielskiego, poziom B2;
  • wskazane cechy: dynamiczny, zmotywowany i dociekliwy.
  • masters degree in biological sciences or biotechnology;
  • previous experience in protein analysis is an advantage;
  • previous experience in biochemistry and molecular biology is an advantage;
  • knowledge of English, level at least B2;
  • dynamic, motivated, and curious.