LABORATORIUM BIOLOGII MOLEKULARNEJ

 

Kierownik: prof. dr hab. n. med. Izabela Zawlik

 

dr n. med. Natalia Potocka

dr n. med. Marzena Skrzypa

 

Lokalizacja

Budynek G4, ul. Warzywna 1A, 35-310 Rzeszów

Pokój: 401, 402, 426, 427.

 

1. Wskazanie obszaru działalności Laboratorium – głównych zainteresowań

Obszar działalności Laboratorium Biologii Molekularnej (LBM) obejmuje badania naukowe w dziedzinie genetyki, biologii molekularnej i epigenetyki w różnych jednostkach chorobowych, głównie w chorobach nowotworowych. W Laboratorium prowadzone są specjalistyczne badania molekularne, m.in. analiza ekspresji genów, analiza ekspresji niekodujących RNA (mikroRNA i długich niekodujących RNA), analiza ekspresji białek, analiza polimorfizmów genetycznych, ocena statusu metylacji promotorów genów, ocena statusu globalnej metylacji oraz analiza wolno-krążącego DNA. Prowadzone badania molekularne dotyczą różnych chorób m.in. raka piersi, raka endometrium, raka jajnika, glejaków, ostrej białaczki szpikowej, przewlekłej białaczki limfatycznej, choroby Alzheimera, cukrzycowej choroby nerek, raka jamy ustnej, szpiczaka, choroby zwyrodnieniowej stawów, choroby Hashimoto. Badania naukowe dotyczą poszukiwania nowych biomarkerów diagnostycznych, prognostycznych i predykcyjnych w powyższych chorobach z zastosowaniem metod molekularnych tj. Real-Time PCR, qMSP, sekwencjonowanie Sangera, NGS, aCGH, ELISA. W Laboratorium prowadzone są badania molekularne z wykorzystaniem różnego rodzaju materiału biologicznego tj. tkanek nowotworowych, krwi pełnej, szpiku, surowicy, osocza, moczu, śliny, płynu mózgowo-rdzeniowego, chrząstki, kości, mleka matki, linii komórkowych. Laboratorium posiada ogromną kolekcję materiału biologicznego zebranego w ciągu dziesięciu lat działalności Laboratorium. Zespół badaczy prowadzi współpracę z wieloma jednostkami klinicznymi i naukowymi zarówno w Polsce jak i na świecie m.in. ze szpitalami w Rzeszowie i w Łodzi, z Uniwersytetem Medycznym w Łodzi, Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych PAN Polskiej Akademii Nauk z siedzibą w Łodzi, Uniwersytetem Medycznym we Wrocławiu i jednostkami zagranicznymi tj. Monash University w Australii. W laboratorium pracuje wysoko wykwalifikowana kadra posiadająca odpowiednie wykształcenie i duże doświadczenie zawodowe. Zespołem kieruje prof. Izabela Zawlik, która posiada wieloletnie doświadczenie w prowadzeniu badań molekularnych i jest autorem ponad 80 publikacji naukowych o sumarycznym IF=200, liczbie cytowań=1490, Indeksie Hirscha=23. Jest również współautorem książki pt.: „Hematologia dla diagnostów laboratoryjnych”. Zespół badaczy opracował i wdrożył wiele procedur badawczych. Zespół badaczy prowadzi również kursy i szkolenia z zakresu diagnostyki molekularnej dla jednostek zewnętrznych, przykładowo dla diagnostów laboratoryjnych w ramach specjalizacji z laboratoryjnej genetyki medycznej i firmy SoftSystem. Laboratorium wyposażone jest w aparaturę na najwyższym poziomie światowym. W ciągu ostatnich ośmiu lat w Laboratorium realizowano siedem prac doktorskich z zakresu biologii molekularnej dotyczących: badań ekspresji mikroRNA, polimorfizmów genetycznych i metylacji DNA w różnych jednostkach chorobowych (ostrych białaczkach, chorobie Alzheimera, raku piersi, glejakach, chorobie zwyrodnieniowej stawów) oraz w populacji osób zdrowych. Obecnie w LBM realizowane są trzy doktoraty.

Numery ORCID pracowników LBM:

  • Prof. dr hab. n med. Izabela Zawlik (0000-0001-7992-9100)
  • Dr n. med. Marzena Skrzypa (0000-0001-7674-5912)
  • Dr n. biol. Alina Zuchowska (0000-0002-0173-057X)
  • Dr n. med. Natalia Potocka (0000-0002-5505-3922)
  • Dr n. o zdr. inż. Sylwia Paszek  (0000-0002-7865-2661)

 

2. Dorobek naukowy:

  • przyznane granty, dofinansowania i współprace:
  1. 2024-2025 projekt NCN MINIATURA 8 nr 2024/08/X/NZ2/01537 pt. »Ocena zaburzeń ekspresji wyselekcjonowanych miRNA w tkance nowotworowej pacjentek z rakiem endometrium z podgrupy molekularnej p53abn''
  2. 2024-2025 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Wpływ czynników środowiskowych na ekspresję wybranych mikroRNA w mleku kobiecym”
  3. 2024-2025 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Rola wybranych lncRNA w rozwoju i progresji raka endometrium”
  4. 2023-2024 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Znaczenie kliniczne wybranych lncRNA w raku endometrium”.
  5. 2023-2024 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Rola wybranych lncRNA w rozwoju i progresji raka jajnika”.
  6. 2022-2024 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: ,,Molekularne profilowanie w celu personalizacji terapii w raku endometrium''.
  7. 2021-2022 projekt badawczy finansowany przez program grantowy PCI (podkarpackie Centrum Innowacji) pt.: ”Rozkład polimorfizmu genów w populacji osób zdrowych w aspekcie sprawności ukierunkowanej na zdrowie”.
  8. 2018-2022 projekt badawczy finansowany przez Fundację Na Ratunek Dzieciom z Chorobą Nowotworową we Wrocławiu pt.: „Kliniczne znaczenie zaburzeń ekspresji mikroRNA w ostrej białaczce limfoblastycznej u dzieci”.
  9. 2018-2019 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Badanie metylacji wybranych genów w wolno krążącym DNA (cfDNA) w surowicy pacjentów z chorobą Alzheimera”.
  10. 2018-2019 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Polimorfizm genów odpowiedzialnych za metabolizm selenu w raku endometrium”.
  11. 2018-2019 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Status metylacyjny promotorów wybranych genów w raku piersi”.
  12. 2018-2019 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Analiza profilu metylacyjnego promotorów wybranych genów w raku endometrium”.
  13. 2018 projekt badawczy realizowany we współpracy z naukowcami z Uniwersytetu Medycznego w Łodzi, Monash University i Australian Synchrotron - Australian Synchrotron Beamline Proposal pt.: „Discrimination of aggressive and classic subtypes of mantle cell lymphomas using offline FPA-FTIR imaging microspectroscopy”.
  14. 2017-2018 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Badania molekularne i spektroskopowe w raku płuca”.
  15. 2017-2018 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Ocena profilu ekspresji long non-coding RNA w raku piersi”. Wykonawca
  16. 2017-2018 projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Mięśniaki zlokalizowane poza macicą - badania genetyczne i epigenetyczne”.
  17. 2017 - projekt badawczy realizowany we współpracy z naukowcami z Monash University i Australian Synchrotron -Australian Synchrotron Beamline Proposal pt.: „FPA-FTIR imaging microspectroscopy for molecular diagnosis of non-small cell lung cancer”.
  18. 2016–2018 - projekt B+R NCBiR, nr POIR.01.01.01-00-0345/15 pt.: „Opracowanie przeciwdrobnoustrojowej folii polietylenowej do pakowania żywności Active Foil (AF)”, działanie 1.1 „Projekty B+R przedsiębiorstw” 1.1.1 „Badania przemysłowe i prace rozwojowe realizowane przez przedsiębiorstwa” współfinansowany ze środków Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego.
  19. 2015-2019 - projekt badawczy MNiSW: “Wybrane aspekty zdrowia studentów w świetle ich aktywności fizycznej i wytrzymałości krążeniowo – oddechowej. E-platforma studentfit jako narzędzie edukacji zdrowotnej studentów”.
  20. 2015-2017 - projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Zaburzenia molekularne w nowotworach żeńskiego układu rozrodczego”.
  21. 2015-2016 – projekt badawczy finansowany ze środków własnych Uniwersytetu Rzeszowskiego (Działalność Statutowa) pt.: „Epigenetyczne biomarkery w chorobie Alzheimera”.
  22. 2011-2016 - projekt badawczy NCN 2011/01/B/NZ4/03345 pt.: ''Profil metylacyjny i ekspresja microRNA w różnych typach nowotworów''.
  • dorobek publikacyjny:
  1. Jaguścik AB, Ziółkowska EI, Wołowiec D, Zawlik I, Soin M, Jarych D, Robak T, Korycka-Wołowiec AB. Venetoclax used alone, or in combination with cladribine, changes the expression of apoptosis-regulating genes in chronic lymphocytic leukemia cells in vitro. Adv Clin Exp Med. 2025 May 28. doi: 10.17219/acem/199382. IF=2,1, MEiN=70
  2. Wiśnik A, Jarych D, Krawiec K, Strzałka P, Potocka N, Czemerska M, Sałagacka-Kubiak A, Pluta A, Wierzbowska A, Zawlik I. Role of MicroRNAs in Acute Myeloid Leukemia. Genes (Basel). 2025 Apr 11;16(4):446. doi: 10.3390/genes16040446. IF=2,9, MEiN=100
  3. Bogaczyk A, Potocka N, Paszek S, Skrzypa M, Zuchowska A, Kośny M, Kluz-Barłowska M, Wróbel A, Wróbel J, Zawlik I, Kluz T. MiR-205-5p and MiR-222-3p as Potential Biomarkers of Endometrial Cancer. Int J Mol Sci. 2025 Mar 14;26(6):2615. doi: 10.3390/ijms26062615. . IF=4,556, MEiN=140
  4. Piotr Strzałka, Kinga Krawiec, Aneta Wiśnik, Izabela Zawlik, Agnieszka Pluta, Agnieszka Wierzbowska. The Role of the Sirtuin Family Histone Deacetylases in Acute Myeloid Leukemia – A Promising Road Ahead. Biomedicines February 2025. DOI: 10.20944/preprints202502.1175. IF=3,9, MEiN=100
  5. Tarhonska K, Wichtowski M, Wow T, Kołacinska-Wow A, Płoszka K, Fendler W, Zawlik I, Paszek S, Zuchowska A, Jabłońska E. DNA Methylation and Demethylation in Triple-Negative Breast Cancer: Associations with Clinicopathological Characteristics and the Chemotherapy Response. Biomedicines 2025, 13, 585. doi.org/10.3390/biomedicines. IF=3,9, MEiN=100
  6. Therapeutic Perspectives of Aminoflavonoids—A Review. Monika Stompor-Gorący, Agata Bajek-Bil, Natalia Potocka, Izabela Zawlik. J. Mol. Sci. 2025, 26(5), 2014; https://doi.org/10.3390/ijms26052014. IF=4,556, MEiN=140
  7. Agata Haśko, Natalia Potocka, Marzena Skrzypa, Halina Bartosik-Psujek, Izabela Zawlik. Prospective use of miRNAs as biomarkers in the diagnosis of Alzheimer's disease. Adv Clin Exp Med. 2024 Dec 19. doi: 10.17219/acem/190273. IF=2,1, MEiN=70
  8. Dariusz Szala, Marta Kopańska, Julia Trojniak, Jarosław Jabłoński, Dorota Hanf-Osetek, Sławomir Snela, Izabela Zawlik. The Role of MicroRNAs in the Pathophysiology of Osteoarthritis. Int J Mol Sci June 2024. DOI: 10.3390/ijms25126352. IF=4,556, MEiN=140
  9. Jasielski P, Zawlik I, Bogaczyk A, Potocka N, Paszek S, Maźniak M, Witkoś A, Korzystka A, Kmieć A, Kluz T. The Promotive and Inhibitory Role of Long Non-Coding RNAs in Endometrial Cancer Course-A Review. Cancers (Basel). 2024 Jun 3;16(11):2125. doi: 10.3390/cancers16112125. IF=5,2, MEiN=140
  10. Anna Bogaczyk, Natalia Potocka, Sylwia Paszek, Marzena Skrzypa, Alina Zuchowska, Michał Kośny, Marta Kluz, Izabela Zawlik, Tomasz Kluz. Absolute Quantification of Selected microRNAs Expression in Endometrial Cancer by Digital PCR. Int J Mol Sci. 2024 Mar 14;25(6):3286. doi: 10.3390/ijms25063286. IF=4,556, MEiN=140
  11. Kluza Katarzyna, Zawlik Izabela, Janowska Magdalena, Kmieć Aleksandra, Paszek Sylwia, Potocka Natalia, Skrzypa Marzena, Zuchowska Alina, Kluz Marta, Wróbel Andrzej, Baszuk Piotr, Pietrzak Sandra, Marciniak Wojciech, Miotła Paweł, Lubiński Jan, Gronwald Jacek, Kluz Tomasz. Study of Serum Copper and Zinc Levels and Serum Cu/Zn Ratio among Polish Women with Endometrial Cancer. 2024. 16(1):144. doi:10.3390/nu16010144. IF=5,717, MEiN= 140
  12. Izabela Zawlik – współautor książki: “Hematologia dla diagnostów laboratoryjnych”. January 2023. DOI: 10.53271/2022.132. ISBN: 9788301228033
  13. Potocka N, Skrzypa M, Zadarko-Domaradzka M, Barabasz Z, Penar-Zadarko B, Sakowicz A, Zadarko E, Zawlik I. Effects of the Trp64Arg Polymorphism in the ADRB3 Gene on Body Composition, Cardiorespiratory Fitness, and Physical Activity in Healthy Adults. Genes (Basel). 2023 Jul 27;14(8):1541. doi: 10.3390/genes14081541. IF= 4,096, MEiN= 100
  14. Barnaś E, Skręt-Magierło JE, Paszek S, Kaznowska E, Potocka N, Skręt A, Sakowicz A, Zawlik I. Two oncomiRs, miR-182-5p and miR-103a-3p, Involved in Intravenous Leiomyomatosis. Genes (Basel). 2023 Mar 14;14(3):712. doi: 10.3390/genes14030712. IF= 4,096, MEiN= 100
  15. Kluza M, Paszek S, Kluza K, Januszek S, Potocka N, Skrzypa M, Zuchowska A, Wróbel A, Baszuk P, Marciniak W, Misiek M, Lubiński J, Gronwald J, Zawlik I, Kluz T. An Assessment of Serum Selenium Concentration in Women with Ovarian Cancer. Nutrients. 2023 Feb 7;15(4):850. doi: 10.3390/nu15040850. IF=5,717, MEiN= 140
  16. Bogaczyk A, Zawlik I, Zuzak T, Kluz M, Potocka N, Kluz T. The Role of miRNAs in the Development, Proliferation, and Progression of Endometrial Cancer. Int J Mol Sci. 2023 Jul 15;24(14):11489. doi: 10.3390/ijms241411489. IF=4,556, MEiN=140
  17. Trąbska-Kluch B, Braun M, Orzechowska M, Paszek S, Zuchowska A, Sołek J, Kluska A, Fijuth J, Jesionek-Kupnicka D, Zawlik I. Potential Prognostic Value of GATA4 Depends on the p53 Expression in Primary Glioblastoma Patients. Genes (Basel). 2023 May 25;14(6):1146. doi: 10.3390/genes14061146. IF= 4,096, MEiN= 100
  18. Kozlik-Siwiec P, Buregwa-Czuma S, Zawlik I, Dziedzina S, Myszka A, Zuk-Kuwik J, Siwiec-Kozlik A, Zarychta J, Okon K, Zareba L, Soja J, Jakiela B, Kepski M, Bazan JG, Bazan-Socha S. Co-Expression Analysis of Airway Epithelial Transcriptome in Asthma Patients with Eosinophilic vs. Non-Eosinophilic Airway Infiltration. Int J Mol Sci. 2023 Feb 14;24(4):3789. doi: 10.3390/ijms24043789. IF=4,556, MEiN=140
  19. Krawiec K, Strzałka P, Czemerska M, Wiśnik A, Zawlik I, Wierzbowska A, Pluta A. Targeting Apoptosis in AML: Where Do We Stand? Cancers (Basel). 2022 Oct 12;14(20):4995. doi: 10.3390/cancers14204995. IF=6,575, MEiN=140
  20. Janowska M, Potocka N, Paszek S, Skrzypa M, Wróbel A, Kluz M, Baszuk P, Marciniak W, Gronwald J, Lubiński J, Zawlik I, Kluz T. An Assessment of Serum Selenium Concentration in Women with Endometrial Cancer. Nutrients. 2022 Feb 24;14(5):958. doi: 10.3390/nu14050958. IF=5,717, MEiN= 140
  21. Kołodziej M, Kaznowska E, Paszek S, Cebulski J, Barnaś E, Cholewa M, Vongsvivut J, Zawlik I. Characterisation of breast cancer molecular signature and treatment assessment with vibrational spectroscopy and chemometric approach. PLoS One. 2022 Mar 9;17(3):e0264347. doi: 10.1371/journal.pone.0264347. eCollection 2022. IF=3,24, MEiN=100
  22. Chaber R, Gurgul A, Tabarkiewicz J, Wróbel G, Szmatoła T, Jasielczuk I, Haus O, Lejman M, Rybka B, Ryczan-Krawczyk R, Jaśkowiec A, Paszek S, Potocka N, Arthur CJ, Bal W, Łach K, Kowal A, Zawlik I, Latos-Grażyńska E. MicroRNA gene methylation landscape in pediatric B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia. Adv Clin Exp Med. 2022 Jan 29. doi: 10.17219/acem/144170. IF=1,58, MEiN=70
  23. Janowska M, Potocka N, Paszek S, Skrzypa M, Żulewicz K, Kluz M, Januszek S, Baszuk P, Gronwald J, Lubiński J, Zawlik I, Kluz T. An Assessment of GPX1 (rs1050450), DIO2 (rs225014) and SEPP1 (rs7579) Gene Polymorphisms in Women with Endometrial Cancer. Genes (Basel). 2022 Jan 21;13(2):188. doi: 10.3390/genes13020188. IF= 4,096, MEiN= 100
  24. Chaber R, Kowal A, Jakubczyk P, Arthur C, Łach K, Wojnarowska-Nowak R, Kusz K, Zawlik I, Paszek S, Cebulski J. A Preliminary Study of FTIR Spectroscopy as a Potential Non-Invasive Screening Tool for Pediatric Precursor B Lymphoblastic Leukemia. 2021 Feb 22;26(4):1174. doi: 10.3390/molecules26041174. IF= 4,411, MEiN=140
  25. Bazan-Socha S, Buregwa-Czuma S, Jakiela B, Zareba L, Zawlik I, Myszka A, Soja J, Okon K, Zarychta J, Kozlik P, Dziedzina S, Padjas A, Wojcik K, Kepski M, Bazan JG. Reticular Basement Membrane Thickness Is Associated with Growth- and Fibrosis-Promoting Airway Transcriptome Profile-Study in Asthma Patients. Int J Mol Sci. 2021 Jan 20;22(3):998. doi: 10.3390/ijms22030998. IF=4,556, MEiN=140
  26. Boguszewska-Byczkiewicz Katarzyna, Jarych Dariusz, Drożdż Izabela, Al Huwaidi Hamed, Zawlik Izabela, Kołacińska Agnieszka. A comparison of four commercial kits used for isolating circulating cell-free DNA : QuickGeneMINI8L (Kurabo), Maxwell RSC cfDNA Plasma Kit (Promega), cfKapture 21 Kit (MagBio), and QIAamp MinElute ccfDNA Kit (Qiagen). Medical Research Journal. 2020: Vol. 5, 2, s. 92-99. MEiN=20
  27. Grzegorz Raba, Izabela Zawlik, Marcin Braun, Sylwia Paszek, Natalia Potocka, Marzena Skrzypa, Bogdan Obrzut, Marek Kluza, Katarzyna Kluza, Barbara Zych, Magdalena Janowska, Tomasz Kluz. Evaluation of the association between angiotensin converting enzyme insertion/deletion polymorphism and the risk of endometrial cancer and characteristics of Polish women. Adv Clin Exp Med. 2020 May;29(5):581-585. doi: 10.17219/acem/118843, IF=1,5, MEiN=70
  28. Jakubek-Kipa Katarzyna, Potocka Natalia, Skrzypa Marzena, Dembiński Łukasz, Zawlik Izabela, Mazur Artur. Methylation status of leptin receptor gene promoter in obese children. Pediatria Polska. 2020 : vol. 95, iss. 2, s. 86-91. MEiN=20
  29. Kolodziej M, Jesionek-Kupnicka D, Braun M, Atamanyuk V, Sloniec S, Cebulski J, Cholewa M, Kopczynski J, Heraud P, Tobin MJ, Vongsvivut J, Zawlik I. Classification of aggressive and classic mantle cell lymphomas using synchrotron Fourier Transform Infrared microspectroscopy. Sci Rep. 2019 Sep 6;9(1):12857. doi: 10.1038/s41598-019-49326-3. IF=4,259, MEiN=140
  30. Dariusz Szala, Joanna Czech, Marzena Skrzypa, Marta Kopanska, Dorota Hanf-Osetek, Krzysztof Gargasz, Grzegorz Guzik, Slawomir Snela, Izabela Zawlik. miRNA expression profile in serum of osteoarthritis patients. Journal of Education, Health and Sport. Nov 2019: 9(11):11. DOI: http://dx.doi.org/10.12775/27719. MEiN= 7
  31. Skrzypa M, Szala D, Gablo N, Czech J, Pajak J, Kopanska M, Trzeciak M, Gargasz K, Snela S, Zawlik I. miRNA-146a-5p is upregulated in serum and cartilage samples of patients with osteoarthritis. Pol Przegl Chir. 2019 Feb 6;91(3):1-5. doi:5604/01.3001.0013.0135. MEiN=20
  32. Kamil Szmuc, Małgorzata Kus-Liśkiewicz, Łukasz Szyller, D. Szmuc, Monika Stompor, Izabela Zawlik, Tomasz Ruman, Stanisław Wołowiec, Józef Cebulski. Silver nanoparticles deposited on calcium hydrogenphosphate - silver phosphate matrix; biological activity of the composite. Polish Journal of Chemical Technology. 2019, Vol. 21, Iss. 2, p. 6-13. IF= 0,550, MEiN=20
  33. Marzena Skrzypa, Natalia Potocka, Halina Bartosik-Psujek, Izabela Zawlik. Genetic risk factors of Alzheimer's disease. European Journal of Clinical and Experimental Medicine. 2019, vol. 17, nr 1, s. 57-66. Review. MEiN= 7,000
  34. Potocka N, Penar-Zadarko B, Skrzypa M, Braun M, Zadarko-Domaradzka M, Ozimek M, Nizioł-Babiarz E, Barabasz Z, Zawlik I, Zadarko E. Association of ACTN3 Polymorphism with Body Somatotype and Cardiorespiratory Fitness in Young Healthy Adults. Int J Environ Res Public Health. 2019 Apr 27;16(9). pii: E1489. doi: 10.3390/ijerph16091489. IF=2,145, MEiN=70
  35. Depciuch Joanna, Zawlik Izabela, Skrzypa Marzena, Pająk Justyna, Potocka Natalia, Łach Kornelia, Bartosik-Psujek Halina, Koziorowska Anna, Kaznowska Ewa, Cebulski Józef. FTIR spectroscopy of cerebral spinal fluid reveals variations in the lipid:protein ratio at different stages of Alzheimer’s disease. Journal of Alzheimer Disease,. 2019;68(1):281-293. doi: 10.3233/JAD-181008. Corresponding author. MNiSW=30, IF=3,476
  36. Kołacińska A, Morawiec J, Herman K, Paszek S, Zawlik I, Śliwczyński A. Improvement in outcomes of breast cancer patient treatment in Poland in the 21st century. The Breast J. 2019, May;25(3):474-478. doi: 10.1111/tbj.13245. MNiSW=25, IF=2,424
  37. Agnieszka Gala-Błądzińska⁠a⁠, Joanna Czech⁠, Marcin Braun⁠, Marzena Skrzypa, Krzysztof Gargasz, Artur Mazur⁠, Izabela Zawlik. Association of 18bp insertion/deletion polymorphism, at −2549 position of VEGF gene, with diabetic vascular complications in type 2 diabetes mellitus. Advances in Medical Sciences, 2019. Mar;64(1):137-143. doi: 10.1016/j.advms.2018.08.011. Epub 2019 Jan 15. MNiSW=15, IF=2,064
  38. Chaber R, Gurgul A, Wróbel G, Tomoń A, Paszek S, Potocka N, Haus O, Lejman M, Łach K, Szmatoła T, Jasielczuk I, Rybka B, Ryczan-Krawczyk R, Stąpor S, Ciebiera K, Arthur CJ, Zawlik I. The distinguishable DNA whole genome methylation profile of 2 cases of pediatric precursor B acute lymphoblastic leukaemia (BCP ALL) with prodromal, preleukemic phase: A case report. Medicine (Baltimore). 2018 Oct;97(42):e12763. doi: 10.1097/MD.0000000000012763. MNiSW=35, IF=2,028
  39. The classification of lung cancers and their degree of malignancy by FTIR, PCA-LDA analysis, and a physics-based computational model. Kaznowska, J. Depciuch, K. Łach, M. Kołodziej, A. Koziorowska, J. Vongsvivut, I. Zawlik, M. Cholewa, J. Cebulski. April 2018, Talanta 186, DOI10.1016/j.talanta.2018.04.083. MNiSW=40, IF=4,244
  40. Paszek S, Gabło N, Barnaś E, Szybka M, Morawiec J, Kołacińska A, Zawlik I. Dysregulation of microRNAs in triple-negative breast cancer. Ginekol Pol. 2017;88(10):530-536. doi: 10.5603/GP.a2017.0097. MNiSW = 15, IF= 0,621
  41. Sobieszkoda D, Czech J, Gablo N, Kopanska M, Tabarkiewicz J, Kolacinska A, Robak T, Zawlik I. MGMT promoter methylation as a potential prognostic marker for acute leukemia. Arch Med Sci. 2017 Oct;13(6):1433-1441. doi: 10.5114/aoms.2017.71067. Epub 2017 Oct 31. MNiSW = 30, IF= 2,344
  42. Chaber R, Gurgul A, Wróbel G, Haus O, Tomoń A, Kowalczyk J, Szmatoła T, Jasielczuk I, Rybka B, Ryczan-Krawczyk R, Duszeńko E, Stąpor S, Ciebiera K, Paszek S, Potocka N, Arthur CJ, Zawlik I. Whole-genome DNA methylation characteristics in pediatric precursor B cell acute lymphoblastic leukemia (BCP ALL). PLoS One. 2017 Nov 10;12(11):e0187422. doi: 10.1371/journal.pone.0187422. eCollection 2017. MNiSW = 35, IF= 2,766
  43. Dorota Jesionek-Kupnicka, Marcin Braun, Berenika Trąbska-Kluch, Joanna Czech, Małgorzata Szybka, Bożena Szymańska, Dominika Kulczycka-Wojdala, Michał Bieńkowski, Radzisław Kordek, Izabela Zawlik. MiR-21, miR-34a, miR-125b, miR-181d and miR-648 levels inversely correlate with MGMT and TP53 expression in primary glioblastoma patients. Arch Med Sci. DOI: https://doi.org/10.5114/aoms.2017.69374. 2019 Mar;15(2):504-512. doi: 10.5114/aoms.2017.69374. Epub 2017 Jul 31. MNiSW = 30, IF= 2,344
  44. Żyła, M. Stompor, M. Kopańska, R. Stagraczyński, J. Fal, T. Traciak, M. Trybus, S. Wolski, I. Zawlik, J. Cebulski, M. Konefał-Janocha, M. Cholewa. The Influence of Sonication and Silver Nanoparticles Doped on Viscoelastic Structure of Agarose Gel. Acta Physica Polonica. A. - 2017, Vol. 132, iss. 1, s. 152-154. MNiSW= 15, IF=0,857
  45. Krzanowski J, Madzio J, Pastorczak A, Tracz A, Braun M, Tabarkiewicz J, Pluta A, Młynarski W, Zawlik I. Selected miRNA levels are associated with IKZF1 microdeletions in pediatric acute lymphoblastic leukemia. Oncol Lett. 2017 Sep;14(3):3853-3861. doi: 10.3892/ol.2017.6599. MNiSW = 15, IF=1,664
  46. Depciuch J, Kaznowska E, Golowski S, Koziorowska A, Zawlik I, Cholewa M, Szmuc K, Cebulski J. Monitoring breast cancer treatment using a Fourier transform infrared spectroscopy-based computational model. J Pharm Biomed Anal. 2017 Sep 5;143:261-268. doi: 10.1016/j.jpba.2017.04.039. MNiSW = 35, IF=2,831
  47. Kopańska M, Szala D, Czech J, Gabło N, Gargasz K, Trzeciak M, Zawlik I, Snela S. MiRNA expression in the cartilage of patients with osteoarthritis. J Orthop Surg Res. 2017 Mar 28;12(1):51. doi: 10.1186/s13018-017-0542-y. MNiSW = 25, IF=1,61
  48. Izabela Zawlik, Ewa Kaznowska, Jozef Cebulski, Magdalena Kolodziej, Joanna Depciuch, Jitraporn Vongsvivut, Marian Cholewa. FPA-FTIR Microspectroscopy for Monitoring Chemotherapy Efficacy in Triple-Negative Breast Cancer. Sci Rep. 2016 Nov 18;6:37333. doi: 10.1038/srep3733. MNiSW = 40, IF=4,259
  49. Fal J, Barylyak A, Besaha K, Bobitski YV, Cholewa M, Zawlik I, Szmuc K, Cebulski J, Żyła G. Experimental Investigation of Electrical Conductivity and Permittivity of SC-TiO 2 -EG Nanofluids. Nanoscale Res Lett. 2016 Dec;11(1):375. doi: 10.1186/s11671-016-1590-7. Epub 2016 Aug 24. MNiSW = 30, IF = 2,833
  50. Zawlik I, Gablo N, Szymanska B, Pawlowska Z, Chudobinski C, Chalubinska-Fendler J, Morawiec Z, Zielinska-Blizniewska H, Morawiec-Sztandera A, Kolacinska A. Immune checkpoints in aggressive breast cancer subtypes. Neoplasma. 2016;63(5):768-73. Doi: 10.4149/neo_2016_514. MNiSW = 15, IF = 1,871
  51. Depciuch J, Kaznowska E, Szmuc K, Zawlik I, Cholewa M, Heraud P, Cebulski J. Comparing paraffined and deparaffinized breast cancer tissue samples and an analysis of Raman spectroscopy and infrared methods. Infrared Physics & Technology 76:217-226: 2016. MNiSW = 25, IF = 1,713
  52. Depciuch J, Kaznowska E, Zawlik I, Wojnarowska R, Cholewa M, Heraud P, Cebulski J. Application of Raman Spectroscopy and Infrared Spectroscopy in the Identification of Breast Cancer. Applied Spectroscopy. 2016 Feb;70(2):251-63. doi: 10.1177/0003702815620127, MNiSW = 30, IF=1,529
  53. Agnieszka Kolacinska, Barbara Cebula‑Obrzut, Lukasz Pakula, Justyna Chalubinska‑Fendler, Alina Morawiec‑Sztandera, Zofia Pawlowska, Izabela Zawlik, Zbigniew Morawiec, Dorota Jesionek‑Kupnicka, Piotr Smolewski. Immune checkpoints: Cytotoxic T-lymphocyte antigen 4 and programmed cell death protein 1 in breast cancer surgery. Oncology Letters. 2015; 10(2):1792-1074. MNiSW = 15, IF=1,482
  54. Agnieszka Kolacinska, Jan Morawiec, Zofia Pawlowska, Janusz Szemraj, Bożena Szymanska, Beata Malachowska, Zbigniew Morawiec, Lukasz Pakula, Robert Kubiak, Izabela Zawlik. Association of microRNA-93, 190, 200b and receptor status in core biopsies from stage III breast cancer patients patients. DNA and Cell Biology. 2014;33(9):624-9. doi: 10.1089/dna.2014.2419. MNiSW = 20, IF = 2,055
  55. Agnieszka Kolacinska, Jan Morawiec, Wojciech Fendler, Zbigniew Morawiec, Janusz Szemraj, Dipanjan Chowdhury, Young Eun Choi, Robert Kubiak, Lukasz Pakula, Izabela Zawlik. Association of microRNAs and pathologic response to preoperative chemotherapy in triple negative breast cancer- preliminary report. Molecular Biology Reports. 2014; 41(5):2851-7. doi: 10.1089/dna.2013.2201. MNiSW = 20, IF = 2,024
  56. Dorota Jesionek-Kupnicka, Malgorzata Szybka, Beata Malachowska, Wojciech Fendler, Piotr Potemski, Sylwester Piaskowski, Dariusz Jaskolski, Wielislaw Papierz, Wieslaw Skowronski, Waldemar Och, Radzislaw Kordek, Izabela Zawlik. TP53 promoter methylation in primary glioblastoma: relationship with TP53 mRNA and protein expression and mutation status. DNA and Cell Biology. 2014 Apr;33(4):217-26. doi: 10.1089/dna.2013.2201. Epub 2014 Feb 7. MNiSW = 20, IF = 2,055
  • udział w krajowych konferencjach naukowych:
  1. N. Potocka (wystąpienie ustne), A. Bogaczyk, A. Rycerz, T. Kluz, I. Zawlik. „Nowe spojrzenie na mechanizmy molekularne raka endometrium: związek między PTEN a miR-205-5p”, VI Ogólnopolska Konferencja Naukowa „Choroby nowotworowe wyzwaniem dla nauk medycznych w XXI wieku” 2025,
  2. Sylwia Paszek (wystąpienie ustne), Izabela Zawlik, Jacek Pszeniczny. „Znaczenie kliniczne ekspresji i metylacji MEG3 w raku piersi”. VI Ogólnopolska Konferencja Naukowa “Choroby nowotworowe wyzwaniem dla nauk medycznych w XXI wieku” Lublin, 16 maja 2025
  3. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie) „Mechanizmy epigenetyczne w chorobach nowotworowych” Spotkanie naukowo-szkoleniowe Polskiego Towarzystwa Diagnostów Laboratoryjnych, Olsztyn, 22.11.2024
  4. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie) “Zastosowanie diagnostyki molekularnej w onkologii ortopedycznej’’. Spotkanie naukowo-szkoleniowe Polskiego Towarzystwa Ortopedyczne i Traumatologiczne, Oddział Podkarpacki, Rzeszów 24.02.2024
  5. Skrzypa Marzena, Potocka Natalia, Bartosik-Psujek Halina, Wiącek Marcin, Braun Marcin, Zawlik Izabela. Influence of polymorphisms in APOE, APOC1, and ACE gens on the risk of Alzheimer's disease. Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. M. Mossakowskiego Neuropathology. Neurogenetics 2019, Warsaw, November 15th 2019
  6. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie) “Badania molekularne w onkologii’’. Spotkanie naukowo-szkoleniowe Polskiego Towarzystwa Patologów, Oddział Podkarpacki, Rzeszów 26.10.2018
  7. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie) “Biologia molekularna w ginekologii”. Spotkanie naukowo-szkoleniowe Polskiego Towarzystwa Ginekologicznego, Oddział Podkarpacki, Rzeszów 04.11.2016
  8. Gaweł Żyła, Monika Stompor, Marta Kopanska, Ryszard Stagraczynski, Jacek Fal, Julian Traciak, Mariusz Trybus, Sławomir, Wolski, Izabela Zawlik, Jozef Cebulski, Malgorzata Konefał-Janocha and Marian Cholewa. The influence of sonication and silver nanoparticles doped on viscoelastic structure of agarose gel. Conference: XII International School on Theoretical Physics SSPCM 2016, Rzeszów
  9. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie po angielsku) ”Epigenetic biomarkers in early diagnostic of Alzheimer disease”. Seminarium z okazji Światowego Dnia Choroby Alzheimera. 25.09.2015 r. Rzeszów
  10. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie) “Medycyna molekularna – nowa era w diagnostyce i terapii”, Konferencja towarzysząca inauguracji Kierunku Lekarskiego na Wydziale Medycznym Uniwersytetu Rzeszowskiego - Nowe techniki medyczne - przełom czy niespełnione nadzieje, Rzeszów 5-6.10.2015
  11. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie) „Molekularne podłoże choroby Alzheimera”. I Międzynarodowa Konferencja Naukowa - problemy osób przewlekle chorych i niepełnosprawnych wyzwaniem dla opieki długoterminowej 15-16.10.2015, Rzeszów
  12. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie) „Biologia molekularna w onkologii” zebranie naukowo-szkoleniowe Polskiego Towarzystwa Diagnostów Laboratoryjnych Oddział w Rzeszowie 10 grudnia 2015 r. Rzeszów
  13. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie) „Epigenetyczne mechanizmy w chorobie Alzheimera”. Międzynarodowe Seminarium poświęcone rozwiązywaniu problemów osób starszych, Uniwersytet Rzeszowski 10 – 12 grudnia 2015, Rzeszów
  14. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie) „Zastosowanie osiągnieć biologii molekularnej w onkologii”. II Ogólnopolska Konferencja Naukowo-Szkoleniowa "Medycyna personalizowana genom-architektura-szkoła-design", Politechnika Lubelska, Lublin 11-14.12.2014
  15. Izabela Zawlik (wykład na zaproszenie) „Choroba Alzheimera – epidemia XXI wieku”. Forum otwierające projekt „Rozbudowa, przebudowa pawilonu nr 10 ZOL dla osób starszych i przewlekle chorych w Górnie wraz z infrastrukturą” realizowany ze środków Mechanizmu Finansowego EOG i Norweskiego Mechanizmu Finansowego 2009-2014 oraz środków własnych Starostwa Powiatowego w Rzeszowie. Rzeszów, 21 listopada 2014
  16. Aleksander Myszka, Aleksandra Siekierzyńska, Wojciech Fendler, Zbigniew Morawiec, Agnieszka Kolacinska, Izabela Zawlik. Zaburzenia ekspresji mikroRNA w potrójnie negatywnym raku piersi. VII Zjazd Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka”. Bydgoszcz 8-10.09.2014
  17. J. Madzio, A. Tracz, J. Krzanowski, M. Braun, A. Pastorczak, A. Sokół-Jażewska, E. Ulińska, M. Matysiak, B. Kazanowska, J. Trelińska, I. Zawlik, W. Młynarski. Analiza ekspresji wybranych microRNA (miRNA) w dziecięcej ostrej białaczce limfoblastycznej (ALL) z delecją genu IKZF1. VII Zjazd Polskiego Towarzystwa Onkologii i Hematologii Dziecięcej. Olsztyn 28 – 31.05.2014.
  • udział w międzynarodowych konferencjach naukowych:
  1. European Human Genetics Conference, 24-27 May 2025, Milan, Italy
  2. Czemerska M, Wisnik A, Jarych D, Zawlik I, Strzałka P, Krawiec K, Cebula-Obrzut B, Majchrzak A, Brzozowski K, Kozlowski M, Pluta A, Wierzbowska A. The Expression of mi-RNAs Involved in the Hematopoietic Niche Microenvironment in Newly Diagnosed AML Patients. 64th ASH (American Society of Hematology) Annual Meeting and Exposition, 2022, 10-13.12.2022, Nowy Orlean, Stany Zjednoczone
  3. Paszek Sylwia, Kołacińska Agnieszka, Braun Marcin, Kaznowska Ewa Beata, Jesionek-Kupnicka Dorota, Barnaś Edyta, Zawlik Izabela. MGMT, BRCA1 and MEG3 Methylation Status in Triple-Negative Breast Cancer. New strategies to prevent, diagnose and treat cancer based on precision medicine : 3rd World Congress on Cancer, September 23-25, 2019, Prague, Czech Republic
  4. Paszek S, Kołacińska A, Braun M, Kaznowska E, Jesionek-Kupnicka D, Słoniec S, Adamczyk J, Barnaś E, Cholewa M, Zawlik I. Methylation status of MGMT and MEG3 gene’s promoters in triple-negative breast cancer. p. 61. The Melbourne International Joint Breast Congress. October 11-13, 2018 Melbourne, Australia
  5. I. Zawlik, J. Czech, M. Kopanska, N. Gablo, J. Tabarkiewicz, D. Sobieszkoda. Alterations of MGMT, P15, TP53 And DNMT3A Genes In Acute Leukemias Patients. Global Cancer, Occurence, Causes and Avenues to Prevention. 7-10 June 2016 Lyon, France
  6. I. Zawlik, M. Kopanska, J. Czech, N. Gablo, M. Szybka, D. Kulczycka-Wojdala, B. Szymanska, M. Braun, B. Trabska-Kluch, D. Jesionek-Kupnicka. Selected miRNAs and their target genes alterations in primary glioblastoma patients. Global Cancer, Occurence, Causes and Avenues to Prevention. 7-10 June 2016 Lyon, France
  7. Zawlik I, Gablo N, Czech J, Kopanska M, Malachowska B, Kolacinska A. Disregulation of MicroRNA Expression In Triple Negative Breast Cancer, Global Cancer, Occurence, Causes and Avenues to Prevention. 7-10 June 2016 Lyon, France
  8. Agnieszka Kolacinska (speaker), Jan Morawiec, Zofia Pawlowska, Janusz Szemraj, Bożena Szymanska, Beata Malachowska, Zbigniew Morawiec, Lukasz Pakula, Robert Kubiak, Izabela Zawlik. Association of microRNA-93, -190, -200b and receptor status in core biopsies in locally advanced breast cancer (LABC) patients. 9th European Breast Cancer Conference, March 19-21, 2014, Glasgow, Scotland

 

3. Możliwość współpracy z otoczeniem gospodarczym:

  • propozycje wykonywanych badań i analiz na zlecenie:

- izolacja kwasów nukleinowych,

- analiza ekspresji genów,

- analiza ekspresji niekodujących RNA (mikroRNA i długich niekodujących RNA),

- analiza ekspresji białek,

- analiza polimorfizmów genetycznych,

- ocena statusu metylacji promotorów genów,

- ocena statusu globalnej metylacji

- analiza wolno-krążącego DNA

  • propozycje usług szkoleniowych i ekspertyz:

- szkolenia i kursy z zakresu diagnostyki genetycznej i molekularnej

- opracowanie procedur z zakresu diagnostyki genetycznej

- analiza wyników PCR i Real-Time PCR

- analiza wyników sekwencjonowania Sangera i NGS