dr hab. Justyna Ruchała, prof. UR
Tel./Phone: +48177854945
e-mail: jruchala@ur.edu.pl
pok./room 117, D10
ORCID 0000-0003-2850-6073
|
|
- Wykaz autorskich artykułów naukowych opublikowanych w czasopismach krajowych lub międzynarodowych / List of original scientific articles published in national journals or international
|
|
brak |
- Wykaz autorskich monografii naukowych / List of author's scientific monographs
|
|
brak |
- Wykaz współautorskich artykułów naukowych / List of co-authored scientific papers
|
1 |
Kurylenko OO, Ruchala J, Hryniv OB, Abbas CA, Dmytruk KV, Sibirny AA. Metabolic engineering and classical selection of the methylotrophic thermotolerant yeast Hansenula polymorpha for improvement of high-temperature xylose alcoholic fermentation, Microb Cell Fact., 2014, 13, 122, doi: 10.1186/s12934-014-0122-3 |
|
2 |
Kurylenko O, Semkiv M, Ruchala J, Hryniv O, Kshanovska B, Abbas C, Dmytruk K, Sibirny A. New approaches for improving the production of the 1st and 2nd generation ethanol by yeast, Acta Biochim Pol., 2016, 63, 31-38, doi: 10.18388/abp.2015_1156 |
|
3 |
Kata I, Semkiv MV, Ruchala J, Dmytruk KV, Sibirny AA. Overexpression of the genes PDC1 and ADH1 activates glycerol conversion to ethanol in the thermotolerant yeast Ogataea (Hansenula) polymorpha, Yeast, 2016, 33, 471-478, doi: 10.1002/yea.3175 |
|
4 |
Ruchala J, Kurylenko OO, Soontorngun N, Dmytruk KV, Sibirny AA. Transcriptional activator Cat8 is involved in regulation of xylose alcoholic fermentation in the thermotolerant yeast Ogataea (Hansenula) polymorpha, Microb Cell Fact., 2017, 16, 36, doi: 10.1186/s12934-017-0652-6 |
|
5 |
Dmytruk KV, Ruchala J, Grabek-Lejko D, Puchalski C, Bulbotka NV, Sibirny AA. Autophagy-related gene ATG13 is involved in control of xylose alcoholic fermentation in the thermotolerant methylotrophic yeast Ogataea polymorpha, FEMS Yeast Res., 2018, 18, doi: 10.1093/femsyr/foy010 |
|
6 |
Kurylenko OO, Ruchala J, Vasylyshyn RV, Stasyk OV, Dmytruk OV, Dmytruk KV, Sibirny AA. Peroxisomes and peroxisomal transketolase and transaldolase enzymes are essential for xylose alcoholic fermentation by the methylotrophic thermotolerant yeast, Ogataea (Hansenula) polymorpha, Biotechnol Biofuels., 2018, 11, 197, doi: 10.1186/s13068-018-1203-z |
|
7 |
Kurylenko O, Rozenfelde L, Khroustalyova G, Vasylyshyn R, Ruchala J, Chang CR, Daugelavicius R, Sibirny A, Rapoport A. Anhydrobiosis in yeasts: Glutathione synthesis by yeast Ogataea (Hansenula) polymorpha cells after their dehydration-rehydration, J Biotechnol., 2019, 304, 28-30, doi: 10.1016/j.jbiotec.2019.08.005 |
|
8 |
Ruchala J, Kurylenko OO, Dmytruk KV, Sibirny AA. Construction of advanced producers of first- and second-generation ethanol in Saccharomyces cerevisiae and selected species of non-conventional yeasts (Scheffersomyces stipitis, Ogataea polymorpha), J Ind Microbiol Biotechnol., 2020, 47, 109-132, doi: 10.1007/s10295-019-02242-x |
|
9 |
Berezka K, Semkiv M, Borbuliak M, Blomqvist J, Linder T, Ruchała J, Dmytruk K, Passoth V, Sibirny A. Insertional tagging of the Scheffersomyces stipitis gene HEM25 involved in regulation of glucose and xylose alcoholic fermentation, Cell Biol Int., 2021, 45, 507-517, doi: 10.1002/cbin.11284 |
|
10 |
Kurylenko OO, Ruchala J, Dmytruk KV, Abbas CA, Sibirny AA. Multinuclear Yeast Magnusiomyces (Dipodascus, Endomyces) magnusii is a Promising Isobutanol Producer, Biotechnol J., 2020, 15, e1900490, doi: 10.1002/biot.201900490 |
|
11 |
Dmytruk KV, Ruchala J, Fedorovych DV, Ostapiv RD, Sibirny AA. Modulation of the Purine Pathway for Riboflavin Production in Flavinogenic Recombinant Strain of the Yeast Candida famata, Biotechnol J., 2020, 15, e1900468, doi: 10.1002/biot.201900468 |
|
12 |
Songdech P, Ruchala J, Semkiv MV, Jensen LT, Sibirny A, Ratanakhanokchai K, Soontorngun N. Overexpression of Transcription Factor ZNF1 of Glycolysis Improves Bioethanol Productivity under High Glucose Concentration and Enhances Acetic Acid Tolerance of Saccharomyces cerevisiae, Biotechnol J., 2020, 15, e1900492, doi: 10.1002/biot.201900492 |
|
13 |
Dzanaeva L, Kruk B, Ruchala J, Nielsen J, Sibirny A, Dmytruk K. The role of peroxisomes in xylose alcoholic fermentation in the engineered Saccharomyces cerevisiae, Cell Biol Int., 2020, 44, 1606-1615, doi: 10.1002/cbin.11353 |
|
14 |
Vasylyshyn R, Kurylenko O, Ruchala J, Shevchuk N, Kuliesiene N, Khroustalyova G, Rapoport A, Daugelavicius R, Dmytruk K, Sibirny A. Engineering of sugar transporters for improvement of xylose utilization during high-temperature alcoholic fermentation in Ogataea polymorpha yeast, Microb Cell Fact., 2020, 19, 96, doi: 10.1186/s12934-020-01354-9 |
|
15 |
Tsyrulnyk AO, Andreieva YA, Ruchala J, Fayura LR, Dmytruk KV, Fedorovych DV, Sibirny AA. Expression of yeast homolog of the mammal BCRP gene coding for riboflavin efflux protein activates vitamin B2 production in the flavinogenic yeast Candida famata, Yeast, 2020, 37, 467-473, doi: 10.1002/yea.3470 |
|
16 |
Semkiv MV, Ruchala J, Dmytruk KV, Sibirny AA. 100 Years Later, What Is New in Glycerol Bioproduction?, Trends Biotechnol, 2020, 38, 907-916, doi: 10.1016/j.tibtech.2020.02.001 |
|
17 |
Ruchala J, Sibirny AA. Pentose metabolism and conversion to biofuels and high-value chemicals in yeasts, FEMS Microbiol Rev, 2021, 45, fuaa069, doi: 10.1093/femsre/fuaa069 |
|
18 |
Kurylenko O, Ruchala J, Kruk B, Vasylyshyn R, Szczepaniak J, Dmytruk K, Sibirny A. The role of Mig1, Mig2, Tup1 and Hap4 transcription factors in regulation of xylose and glucose fermentation in the thermotolerant yeast Ogataea polymorpha, FEMS Yeast Res., 2021, 21, foab029, doi: 10.1093/femsyr/foab029 |
|
19 |
Dzanaeva L, Kruk B, Ruchala J, Sibirny A, Dmytruk K. The impact of transcription factors Znf1, Sip4, Adr1, Tup1, and Hap4 on xylose alcoholic fermentation in the engineered yeast Saccharomyces cerevisiae, Antonie Van Leeuwenhoek, 2021, 114, 1373-1385, doi: 10.1007/s10482-021-01607-6 |
|
20 |
Ruchala J, Andreieva YA, Tsyrulnyk AO, Sobchuk SM, Najdecka A, Wen L, Kang Y, Dmytruk OV, Dmytruk KV, Fedorovych DV, Sibirny AA. Cheese whey supports high riboflavin synthesis by the engineered strains of the flavinogenic yeast Candida famata, Microb Cell Fact, 2022, 21, 161, doi: 10.1186/s12934-022-01888-0 |
|
21 |
Semkiv MV, Ruchala J, Tsaruk AY, Zazulya AZ, Vasylyshyn RV, Dmytruk OV, Zuo M, Kang Y, Dmytruk KV, Sibirny AA. The role of hexose transporter-like sensor hxs1 and transcription activator involved in carbohydrate sensing azf1 in xylose and glucose fermentation in the thermotolerant yeast Ogataea polymorpha, Microb Cell Fact, 2022, 21, 162, doi: 10.1186/s12934-022-01889-z |
|
22 |
Fedorovych DV, Tsyrulnyk AO, Ruchala J, Sobchuk SM, Dmytruk KV, Fayura LR, Sibirny AA. Construction of the advanced flavin mononucleotide producers in the flavinogenic yeast Candida famata, Yeast, 2023, doi: 10.1002/yea.3843 |
- Wykaz współautorskich monografii naukowych oraz udział w opracowaniach zbiorowych zrealizowanych we współautorstwie / List of co-authored scientific monographs and participation in collective studies realized in co-authorship
|
1 |
Dmytruk KV, Kurylenko OO, Ruchala J, Abbas CA, Sibirny AA. Genetic improvement of conventional and nonconventional yeasts for the production of first- and second-generation ethanol, In: Biotechnology of Yeasts and Filamentous Fungi, Springer, 2017, doi: 10.1007/978-3-319-58829-2_1 |
|
2 |
Dmytruk K, Kurylenko O, Ruchala J, Ishchuk O, Sibirny A. Development of the thermotolerant methylotrophic yeast Hansenula polymorpha as efficient ethanol producer, In: Yeast Diversity in Human Welfare. Springer, 2017, doi: 10.1007/978-981-10-2621-8_11 |
|
3 |
Semkiv M, Kurylenko O, Ruchala J, Hryniv O, Kshanovska B, Dmytruk K, Sibirny A. Yeast alcoholic fermentation: achievements and challenges, In: Modern directions in chemistry, biology, pharmacy and biotechnology. Lviv Politechnic National University, 2015, 235-248, ISBN 978-617-607-824-1 |
|
4 |
Semkiv MV, Kurylenko OO, Ruchala J, Hryniv OB, Dmytruk KV, Sibirny AA. Yeast metabolic engineering for construction of the advanced bioethanol producers from renewable feedstocks In: Living organisms and bioanalytical approaches for detoxification and monitoring of toxic compounds. University of Rzeszow in corporation with Institute of Cell Biology National Academy of Sciences of Ukraine, 2015, 333-341, ISBN 978-83-7667-203-8 |
|
5 |
Kurylenko O, Ruchala J, Dmytruk K, Sibirny A. New targets for improvement of xylose alcoholic fermentation in the methylotrophic yeast Hansenula polymorpha, In: Living organisms and bioanalytical approaches for detoxification and monitoring of toxic compounds. University of Rzeszow in corporation with Institute of Cell Biology National Academy of Sciences of Ukraine, 2015, 247-257, ISBN 978-83-7667-203-208 |
|
6 |
Ruchala J, Kurylenko OO, Sibirny AA. Production of glutathione by yeasts and the role of this thiol in methylotrophic metabolism and xenobiotic detoxification. In: Living organisms and bioanalytical approaches for detoxification and monitoring of toxic compounds. University of Rzeszow in corporation with Institute of Cell Biology National Academy of Sciences of Ukraine, 2015, 227-236, ISBN 978-83-7667-203-208 |
- Wykaz wystąpień na krajowych lub międzynarodowych konferencjach naukowych lub artystycznych, z wyszczególnieniem przedstawionych wykładów na zaproszenie (WZ) i wykładów plenarnych (WP), wystąpienie ustne (WU) / List of presentations at national or international scientific or artistic conferences, specifying presented invited lectures (WZ) and plenary lectures (WP), oral presentation (WU).
|
|
Autorzy, tytuł wystąpienia, dane konferencji |
Typ wykładu |
|
1 |
Ruchala J. The impact of CAT8 transcriptional activator on regulation of xylose alcoholic fermentation in non-conventional yeasts, International Symposium on Cell Biology jointly with 5th Ukrainian Congress for Cell Biology, 2016, Odessa, Ukraina |
WZ |
|
2 |
Ruchala J, Kurylenko O, Nielsen JB, Dmytruk K, Sibirny A. Peroxisomes are indispensable for xylose alcoholic fermentation in the methylotrophic but not in the non-methylotrophic yeasts, 7th International Weigl Conference, 2017, Lwów, Ukraina |
WZ |
|
3 |
Ruchala J, Kurylenko O, Vasylyshyn R, Bratiychuk D, Kruk B, Dmytruk K, Sibirny A. Role of the peroxisomes and pentose-phosphate pathway in xylose alcoholic fermentation of conventional and non-conventional yeasts, 4th Congress of Baltic Microbiologists, 2018, Gdańsk, Polska |
WZ |
|
4 |
Ruchala J, Kurylenko O, Kruk B, Dmytruk K, Sibirny A. The role of peroxisomes in xylose alcoholic fermentation in the thermotolerant methylotrophic yeast Ogataea polymorpha, Advances in Microbiology and Biotechnology, 2018, Lwów, Ukraina |
WZ |
|
5 |
Ruchala J, Kurylenko O, Vasylyshyn R, Bratiychuk D, Dmytruk K, Sibirny A. Role of the peroxisomes and pentose phosphate pathway in xylose alcoholic fermentation In the thermotolerant yeast Ogataea polymorpha, FEBS 3+ Meeting - XI Parnas Conference – Young Scientists Forum. Biochemistry and Molecular Biology for Innovative Medicine, 2018, Kijów, Ukraina |
WZ |
|
6 |
Ruchala J, Kurylenko O, Dmytruk K, Sibirny A. Importance of peroxisomes and peroxisomal enzymes of pentosephosphate pathway for xylose alcoholic fermentation in the thermotolerant methylotrophic yeast Ogataea polymorpha, 6th Ukrainian Congress for Cell Biology with international representation, 2019, Yaremche, Ukraina |
WZ |
|
7 |
Ruchala J, Tsyrulnyk A, Fayura L, Fedorovych D, Motyka O, Marx H, Mattanovich D, Sibirny A. Construction of the riboflavin-overproducing strain of the yeast Komagataella pastoris producing flavin antibiotic aminoriboflavin, 8th International Weigl Conference, 2019, Łódź, Polska |
WZ |
|
8 |
Ruchala J, Tsyrulnyk A, Fayura L, Fedorovych D, Motyka O, Marx M, Mattanovich D, Sibirny A. Construction of the riboflavin-overproducing strain of the yeast Komagataella pastoris producing the flavin antibiotic aminoriboflavin, The 35th International Specialised Symposium on Yeasts, 2019, Antalya, Turcja |
WZ |
|
9 |
Ruchala J. Construction of the recombinant yeasts Komagataella phaffii and Candida famata producing bacterial antibiotics aminoriboflavin and roseoflavin, CA18229_YEAST4BIO 1st WG meeting, 2020, Budapeszt, Węgry |
WZ |
|
10 |
Ruchala J. The role of transcription factors in xylose alcoholic fermentation in the yeast Ogataea polymorpha, 1st International Conference of Young Scientists Current Issues in Cell Biology and Biotechnology, 2021, Lwów, Ukraina |
WZ |
|
11 |
Ruchała J, Kurylenko O, Sybirny A. Konstruowanie szczepów drożdży Hansenula polymorpha z ulepszonymi parametrami alkoholowej fermentacji ksylozy, Międzynarodowa Konferencja naukowa - Jakość życia w Bio-, Tech- i Ekosystemach poświęcona twórczości Prof. Franciszka Chrapkiewicza- Chapeville’a, 2014, Rzeszów, Polska |
WU |
|
12 |
Ruchała J, Kurylenko O, Vasylyshyn R, Semkiv M, Dmytruk O, Tsaruk A, Zazulia A, Dmytruk K, Sibirny A. Thermotolerant yeast Ogataea polymorpha as promising producer of the second generation ethanol, 1st Polish Yeast Conference, 2022, Rzeszow, Poland |
WU |
- Wykaz udziałów w komitetach organizacyjnych i naukowych konferencji krajowych lub międzynarodowych, z podaniem pełnionych funkcji / List of participations in the organizing and scientific committees of national or international conferences, stating the functions held
|
|
Nazwa konferencji, miejsce, data |
Funkcja |
|
1 |
6-ta Międzynarodowa Konferencja Młodych Naukowców „Human-Nutrition-Environment”, Rzeszów, Polska, 2016 |
Członek komitetu naukowego |
|
2 |
International Conference Advances in Microbiology and Biotechnology, Lwów, Ukraina, 2018 |
Członek komitetu organizacyjnego |
|
3 |
Non-conventional Yeasts: from Basic Research to Application, Rzeszów Polska, 2018 |
Przewodniczący sekretariatu konferencji |
|
4 |
1st Polish Yeasts Conference, Rzeszów, Polska, 2022 |
Przewodniczący sekretariatu konferencji, członek komitetu naukowego |
- Wykaz uczestnictwa w pracach zespołów badawczych realizujących projekty finansowane w drodze konkursów krajowych lub zagranicznych, z podziałem na projekty zrealizowane i będące w toku realizacji oraz z uwzględnieniem informacji o pełnionej funkcji w ramach prac zespołów / List of participation in the work of research teams carrying out projects financed through domestic or foreign competitions, with a breakdown into completed and ongoing projects and including information on the function performed in the work of the teams
|
|
Tytuł projektu, organizacja fundująca, okres trwania |
Funkcja |
|
1 |
Non-conventional yeasts for ethanol, chemical and food production: Next generation techniques for manipulation and analysis, Visby, grant Instytutu Szwedzkiego (SI), 2012-2014 |
Wykonawca |
|
2 |
Scientific integration of the Polish-Ukraine borderland area in the field of monitoring and detoxification of harmful substances in environment, projekt współfinansowany przez Unię Europejską w ramach Programu Współpracy Transgranicznej Polska-Białoruś-Ukraina 2007-2013, 2013 -2015 |
Wykonawca |
|
3 |
Zastosowanie inżynierii metabolicznej drożdży do konstruowania ulepszonych producentów etanolu, NCN, 2013-2016 |
Wykonawca |
|
4 |
Studying the role of CAT8 transcriptional activator in the yeast xylose alcoholic fermentation, Federacja Europejskich Towarzystw Mikrobiologicznych - FEMS, 04-07.2016 |
Wykonawca |
|
4 |
Rola czynników transkrypcyjnych w regulacji metabolizmu oraz fermentacji glukozy i ksylozy u niekonwencjonalnych drożdży Ogataea polymorpha, NCN, 2017-2022 |
Wykonawca |
|
5 |
Genetyczna kontrola metabolizmu oraz fermentacji alkoholowej pentoz (D-ksyloza, L-arabinoza) u termotolerancyjnych drożdży Ogataea polymorpha, NCN, 2019-2024 |
Wykonawca |
|
6 |
Mechanizmy regulatorowe zaangażowane w nadprodukcję ryboflawiny u flawinogennych drożdży Candida famata, NCN, 2019-2022 |
Wykonawca |
|
7 |
Konstruowanie oraz właściwości rekombinowanych drożdżowych szczepów produkujących bakteryjne antybiotyki rozeoflawinę oraz aminoryboflawinę, NCN, 2022-2025 |
Wykonawca |
8. Dodatkowe informacje o innych aktywnościach naukowych / Additional information about other scientific activities
8.1. Patenty i zgłoszenia patentowe / Patents and patent applications
|
|
Nr patentu |
Autorzy, tytuł patentu, data przyznania |
|
1 |
P.436255 |
Ruchała J, Nikiel A, Wnuk M., Otrzymanie i zastosowanie wyrobu pigmentowego na bazie ekstraktu Serratia marcescens jako materiału plastyczno-artystycznego (data zgłoszenia 2020-12-04) |
|
2 |
P.441040 |
Zadrąg-Tęcza R., Durak R., Ruchała J., Szpyrka E., Maślanka R., Potocki L., Kus-Liśkiewicz M., Chrzanowski G., Wnuk M. Szczep drożdży niekonwencjonalnych Aureobasidium pullulans URC2 zdolny do wydajnej produkcji kwasu linolowego w standardowej pożywce typu YPD (data zgłoszenia 26-04-2022) |
|
3 |
P.441673 |
Dmytruk K, Semkiw M, Dmytruk O, Vasylyshyn R, Fayura L, Zazulya A, Gaffke L, Podlach M, Cyske Z, Pierzynowska K, Wegrzyn G, Ruchala J, Sybirnyy A. Kaseta ekspresyjna, wektor ekspresyjny, zawierające go komórka Escherichia coli i humanizowane komórki szczepów drożdży Komagataella phaffii lub Ogataea polymorpha oraz ich zastosowanie do wytwarzania szczepionki na koronawirusa SARS-CoV-2 i szczepionka na koronawirusa SARS-CoV-2 (data zgłoszenia 07.07.2022) |
|
4 |
P.442422 |
Sybirnyy A, Ruchała J, Najdecka A, Fedorovych D. Sposób wytwarzania ryboflawiny w podłożach z hydrolizatami lignocelulozy przy użyciu flawinogennych drożdży Candida famata (data zgłoszenia 30.09.2022) |
|
5 |
P.435340 |
Sybirnyy A, Ruchala J, Vasylyshyn R, Kurylenko O, Dmytruk K. Sposoby uzyskania drożdżowych producentów etanolu z ksylozy z termotolerancyjnych drożdży Ogataea polymorpha (data zgłoszenie 15.09.2020) |
|
6 |
P.435341 |
Sybirnyy A, Ruchala J, Fedorovych D, Wojtuń A, Znamirowska A, Dmytruk K, Tsyrulnyk A. Nowy szczep drożdży Candida famata zdolny do nadprodukcji ryboflawiny, zastosowanie szczepu drożdży Candida famata BCRP do wytarzania ryboflawiny oraz sposób wytwarzania ryboflawiny (data zgłoszeni 15.09.2020) |
8.2. Osiągnięcia w zakresie kształcenia kadr naukowych / Achievements in the training of scientific personnel
1. pełnienie funkcji promotora osób, które uzyskały stopień doktora lub mają otwarty przewód doktorski, ze wskazaniem nazwiska i imienia, tytułu rozprawy doktorskiej, jednostki, która nadała stopień lub w której otwarto przewód doktorski, roku nadania stopnia lub otwarcia przewodu doktorskiego / Serving as a thesis supervisor of persons who have received a doctoral degree or have an open doctoral dissertation, indicating the name, title of the dissertation, the unit that conferred the degree or in which the doctoral dissertation was opened, the year the degree was conferred or the doctoral dissertation opened
|
|
brak |
2. pełnienie funkcji recenzenta rozpraw doktorskich oraz w postępowaniu o nadanie stopnia doktora habilitowanego lub tytułu naukowego profesora / Serving as a reviewer of doctoral dissertations and in proceedings for the award of the degree of doctor habilitated or the title of professor
|
|
Imię i nazwisko |
Tytuł rozprawy doktorskiej, postępowania o nadanie dr hab. lub tytułu profesora, jednostka |
Rok |
|
1 |
mgr inż. Katarzyna Kosiorowska |
Badanie zdolności fizjologicznych drożdży Yarrowia lipolytica do rozkładu tworzyw sztucznych, Wydział Nauk Biologicznych, Uniwersytet Wrocławski |
2023 |
|
2 |
mgr inż. Monika Kubiak-Szymendera |
Manipulacje komórkową odpowiedzią na stres jako strategia zwiększająca nadprodukcję heterologicznych białek w komórkach drożdży niekonwencjonalnych Yarrowia lipolytica, Wydział Medycyny Weterynaryjnej i Nauk o Zwierzętach, Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu |
2023 |
|
3 |
dr Przemysław Grudnik |
Badania strukturalne i biochemiczne fosfotransferaz: ADP- i ATP-zależnych glukokinaz oraz kinazy glicerolu, Uniwersytet Jagielloński |
2023 |
Inne istotne osiągnięcia naukowe, organizacyjne oraz aktywności naukowe / Other significant scientific, organizational achievements and scientific activities
- 2019-2022, członek zespołu programowego ds. kierunku Biologia
- 2022- obecnie, funkcji kierownika kierunku Biologia w Uniwersytecie Rzeszowskim
8.4. Członkostwo i pełnione funkcje w krajowych i zagranicznych towarzystwach i organizacjach naukowych / Memberships and positions held in national and international scientific societies and organizations
|
|
Członkostwo |
Funkcja |
|
1 |
Polskie Towarzystwo Mikrobiologów |
Członek |
|
2 |
COST (European Cooperation in Science and Technology), YEAST4BIO |
Wice-lider grupy |