Zmiany profilu proteomicznego mikroglonów Chlorella sorokiniana w warunkach stresu abiotycznego /Changes in the proteomic profile of green microalgae Chlorella sorokiniana under abiotic stress conditions
|
|
Opis w języku polskim |
Description in English |
|
Dyscyplina / Discipline |
nauki biologiczne |
biological sciences |
|
Promotor / Supervisor |
Dr hab. Grzegorz Chrzanowski, prof. UR gchrzanowski@ur.edu.pl |
Dr hab. Grzegorz Chrzanowski, prof. UR gchrzanowski@ur.edu.pl |
|
Tytuł tematu badawczego / Title of the research topic |
Zmiany profilu proteomicznego mikroglonów Chlorella sorokiniana w warunkach stresu abiotycznego |
Changes in the proteomic profile of green microalgae |
|
Opis tematu badawczego / Description of the research topic |
Czynniki środowiskowe, takie jak stresy biotyczne i abiotyczne, mogą powodować ograniczenia wzrostu i rozwoju roślin oraz zielonych mikroalg. Stresy te mogą również generować wybuch oksydacyjny oraz zaburzać homeostazę komórkową. Z tego też względu, mikroglony syntezują różne grupy metabolitów (jak wielonienasycone kwasy tłuszczowe, karotenoidy, witaminy i związki fenolowe) w celu przeciwdziałania niekorzystnym skutkom stresu. Należy podkreślić, że zmiany w profilu proteomicznym wyraźnie obrazują indukcje mechanizmów odpornościowych jak również wzajemnych zależności biochemicznych w broniących się komórkach. Dlatego w naszym laboratorium staramy się krytycznie opisać wpływ czynników abiotycznych i biotycznych na profil białek i metabolom oraz ich rolę w zwalczaniu czynników stresogennych. Badania prowadzone przez doktoranta polegać będą na analizie metabolitów metodą HPLC/UHPLC sprzężonej ze spektrometrią mas, detekcją fluorescencyjną lub UV-VIS oraz przedstawieniu zmian w profilu proteomicznym mikroglonów w warunkach stresu. |
Environmental factors such as biotic and abiotic stresses cause a decrease in the growth and development of plants and green microalgae. These conditions may generate oxidative burst and disturb cellular homeostasis. Therefore, microalgae produce different groups of metabolites (such as polyunsaturated fatty acids, carotenoids, vitamins, and phenolic compounds) to alleviate these adverse effects. The changes in the proteomic profile effectively draw induction of resistance mechanisms and biochemical relationships within defending cells. Thus, in our lab, we aim to give a critical account of the influence of the abiotic and biotic factors on protein profile and metabolome and their role against stressors. Research conducted by the Ph.D. student will involve the analysis of metabolites by HPLC/UHPLC coupled to mass spectrometry, fluorescence or UV-VIS detection, and drawing changes in a proteomic profile under stress conditions. |
|
Słowa klucze / Keywords |
metabolomika, elektroforeza SDS-PAGE, identyfikacja białek, chromatografia cieczowa sprzężona ze spektrometrią mas |
metabolomics, SDS-PAGE electrophoresis, protein identification, liquid chromatography coupled mass spectrometry |
|
Oczekiwane kompetencje/umiejętności od kandydata na doktoranta / Expected competences/skills from the candidate for a PhD student |
|
|