lnc RNA w MIZS / lnc RNA in JIA

 

Pełny temat badawczy: Ocena roli wybranych lncRNA w patogenezie Młodzieńczego Idiopatycznego Zapalenia Stawów

Promotor: prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Jacek Tabarkiewicz 

e-mail: [email protected]

Streszczenie: Zarówno MIZS, jak i RZS są chorobami należącymi do autoimmunizacyjnych zapaleń stawów, to jednak MIZS jest czymś więcej niż tylko pediatryczną wersją RZS, co można to potwierdzić różnicami w patogenezie i klinicznym przebiegu choroby. Projekt ma na celu poszerzenie wiedzy na temat patogenezy MIZS i molekularnych regulacji procesu zapalnego zachodzącego w MIZS. Mając na uwadze niewielką liczbę publikacji poświęconych roli lncRNA w MIZS i dążąc do odpowiedzi na pytanie, czy podobne lncRNA są zaangażowane w patogenezę MIZS i RZS, w projekcie zrealizowane  zostaną następujące cele badawcze: „1” Poszerzenie wiedzy na temat patogenezy MIZS poprzez potwierdzenie, czy ekspresja wybranych IncRNA jest zaangażowana w patogenezę MIZS. „2” odpowiedź na pytania, czy MIZS i RZS mają wspólny profil lncRNA oraz które podtypy MIZS są podobne do RZS na poziomie molekularnym. Badanie będzie podstawą do opracowania nowych biomarkerów  i nowych leków mających zastosowane w diagnostyce i terapii MIZS. Ekspresja wbranych lncRNA zostanie oszacowana za pomocą cyfrowego PCR, co zapewni pomiar rzeczywistej liczby kopii wybranych lncRNA, nawet dla cząsteczek o bardzo niskiej ekspresji. Dodatkowo za pomocą testu ELISA oznaczone zostaną stężenia cytokin, które są obecnie wykorzystywane jako cele terapeutyczne w MIZS i RZS. Ekspresja lncRNA będzie również skorelowana z odsetkiem subpopulacji limfocytów T oszacowanym za pomocą cytometrii przepływowej. W celu wyciągnięcia wniosków wykorzystana zostanie jedno- i wielowymiarowa analiza statystyczna. Wyniki naszego projektu pomogą potwierdzić różnice między MIZS i RZS, a także wskazać pewne podobieństwa między podtypami MIZS, takimi jak zapalenie wielostawowe z dodatnim RF i RZS. Wierzymy również, że wyniki tego projektu mogą zwrócić uwagę na MIZS i zachęcić naukowców do skupienia się na tego typu zapaleniu stawów, co może zaowocować lepszym zrozumieniem tej choroby, opracowaniem nowych narzędzi diagnostycznych i schematów leczenia. Identyfikacja lncRNA związanego z MIZS może dostarczyć nowych biomarkerów MIZS i celów terapeutycznych. Długofalowym efektem tego projektu może być poprawa jakości opieki zdrowotnej i terapii MIZS oraz zmniejszenie niepełnosprawności pacjentów.

Wymagania dla kandydata: 

  • Wymagane: znajomość podstawowych zasad pracy w laboratorium, doświadczenie w realizacji projektów naukowych potwierdzone min. 1 doniesieniem zjazdowym
  • Pożądane: min. 1 publikacja naukowa w czasopiśmie z listy JCR, udział w pracach koła naukowego z związanymi z zagadnieniami immunologii i/lub reumatologii, udział w przygotowaniu aplikacji grantowej

 

 

Research Topic: Assessment of the role of selected lncRNAs in the pathogenesis of Juvenile Idiopathic Arthritis

Supervisor: prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Jacek Tabarkiewicz 

e-mail: [email protected]

Abstract: Though both JIA and RA are types of inflammatory arthritis, JIA is much more than a kid-sized version of adult RA and it could be confirmed by differences in pathogenesis and clinical course of disease. This project aims to broaden knowledge pathogenesis of JIA and molecular regulations of inflammatory process ongoing in JIA. Taking into consideration the paucity of publication focused on the role of lncRNAs in JIA and aiming to answer the question if similar lncRNAs are involved into JIA and RA pathogenesis, we set following research objectives: （1） Increasing knowledge about JIA pathogenesis by confirming whether the expression of IncRNAs is involved in the pathogenesis JIA. (2) Confirm which subtypes of JIA are similar to RA; analyze the expression of lncRNA in the cells of patients with JIA and compare it with previously published results considering RA to confirm whether JIA and RA share profile of lncRNAs. By analyzing the expression of lncRNA in the peripheral blood of JIA patients lay a theoretical foundation for the development of new reagents and new drugs for the diagnosis and treatment of JIA patients, and make basic preparations for further in-depth research on JIA. Expression of selected lncRNAs will estimated by digital PCR, what ensure measuring the real number of copies even for low expressed target. Additionally check with the use of ELISA, we will the concentrations of cytokines, which are now used as therapeutic targets in JIA and RA. Expression of lncRNA will be also correlated with percentages of T cells subpopulations estimated by flow cytometry. Univariate and multivariate statistical analysis will be used to draw conclusions Results of our project will help to confirmed differences between JIA and RA and also point some similarities between subtypes of JIA like RF positive polyarthritis and RA. We also believe that results of this Project can draw attention to JIA and stimulate researchers to focused on this type arthritis and it could results in better understanding of this disease, development of new diagnostic tools and treatment regimes. Identification of lncRNA associated with JIA could provide new JIA biomarkers and therapeutical targets. Long term effect of this project could be increase in quality of health care and therapy of JIA and reduction of patients disabilities.

Requirements for the candidate:

  • Required: knowledge of the basic principles of working in the laboratory, experience in the implementation of scientific projects confirmed min. 1 by a congress report
  • Desirable: min. 1 scientific publication in a journal from the JCR list, participation in the work of a research club related to the issues of immunology and / or rheumatology, participation in the preparation of a grant application